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第1章dna、rna和蛋白质序列信息资源

上传者:hnxzy51 |  格式:ppt  |  页数:66 |  大小:2193KB

文档介绍
获取、处理、储存、传播、分析、模拟和解释的交叉学科。Р生物信息学研究内容Р它利用数据库技术和软件技术对大量积累的生物大分子序列数据进行比较和分析,揭示出生物大分子的分子结构、功能和进化关系以及基因组构成与基因表达等生物学事件对生命活动的影响。Р生物信息学研究重点Р主要体现在基因组学(genomics)和蛋白质组学(proteomics)两方面。它从核酸和蛋白质序列出发,分析序列中与结构、功能相关的生物信息的表达。Р生物信息学数据库Р生物信息学中的各类数据库几乎覆盖了生命科学的各个领域,如核酸序列数据库,蛋白质序列数据库,蛋白质、核酸、多糖的三维结构数据库,基因组数据库,文献数据库和其他种类数据库。Р生物信息学数据库分类Р生物信息数据库种类繁多,就目前来看, 大体可以分为四个大类: ? 1.基因组数据库;? 2.核酸和蛋白质一级结构序列数据库;? 3.生物大分子(主要是蛋白质)三维空间结构数据库;Р 4.根据以上三类数据库和文献资料为基础构建的二次数据库。也称专门数据库、?专业数据库或专用数据库。Р一次数据库Р第二节核酸序列数据库?Section 2 Nucleic Acid sequence DatabasesР自20世纪80年代第一个核酸数据库建立以来,核酸数据库迅速发展。在互联网上不仅有核酸序列数据库,还出现了基因组相关数据库、核酸三维结构数据库、基因表达数据库、人类基因突变及疾病相关数据库、进化相关数据库及其他与核酸有关的数据库。Р三大核酸序列数据库РGenBank?EMBL?DDBJР特殊类型核酸序列数据库:Р非编码RNA数据库(ncRNA);?表达序列标签数据库(dbEST);?序列标签位点数据库(dbSTS);?miRBase ;?tRNAdb等。Р基因组相关数据库:Р人类基因组数据库(HGD);?基因组序列数据库(GSDB);?基因组在线数据库(GOLD)等。

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