转录组测序技术

编码RNA。Р转录组(transcriptome)Р狭义:指所有mRNA的集合。Р5Р2014-4-1РRNA-Seq 技术背景Р转录组测序技术:是指利用第二代高通量测序技术进行cDNA测序,全面快速地获取某一物种特定器官或组织在某一状态下的几乎所有转录本。Р6Р2014-4-1РRNA-Seq 技术背景Р高通量测序技术(High-throughput sequencing)是指能够一次并行对几十万到几百万条DNA分子进行序列测序,每一次序列测定的读长一般较短的测序技术。?高通量测序技术是对传统测序一次革命性的改变,一次对几十万几百万条DNA分子进行序列测序,因此在有些文献中称其为下一代测序技术(next generation sequencing)组件其划时代的改变,同时高通量测序使得对一个物种的转录组和基因组进行细致全貌的分析成为可能,所以又被称为深度测序(deep sequencing)Р7Р2014-4-1РRNA-Seq 技术背景Р有关于ncRNA的一些知识Р非编码RNA(ncRNA)主要包括:转运RNA(tRNA),核糖体RNA(rRNA),小核RNA(snRNA),核仁小分子RNA(snoRNA),细胞质小分子RNA(scRNA),不均一核RNA(hnRNA)及小RNA(microRNA,miRNA)等。?功能:非编码RNA具有调节基因表达的作用,如对染色体结构、RNA加工修饰及稳定性、转录和翻译及一些蛋白质稳定性的影响。Р8Р第二节РRNA-Seq 技术原理Р2014-4-1Р把高通量测序技术应用到有mRNA逆转录生成的cDNA上,从而获得来自不同基因的mRNA片段在特定样本中的含量,这就是mRNA片段或mRNA-Seq,同原理,各种类型的转录本都可以用深度测序技术进行高通量检测,统称作RNA-Seq。Р9Р2014-4-1РRNA-Seq 实验流程图Р10