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转录组高通量测序转录组数据分析差异表达基因分析 PPT

上传者:似水流年 |  格式:ppt  |  页数:67 |  大小:2202KB

文档介绍
ics),是研究细胞表型和功能的一个重要手段。21.2转录组研究的重要性转录组是连接基因组遗传信息与生物功能的蛋白质组的纽带,转录水平的调控是最重要也是目前研究最广泛的生物体调控方式。转录组的研究比基因组的研究能给出更高效的有用信息。与基因组不同,转录组更有时间空间性。除了异常的mRNA降解现象(如转录衰减)以外,转录组反映的是特定条件下活跃表达的基因3转录组的研究可以提供什么条件下什么基因表达什么信息,从而推断相应未知基因的功能,揭示特定调节基因的作用机制对转录本的定量可以了解特定基因的活性和表达量,用于疾病的诊断和治疗通过对转录组的研究,也让个性化医疗的目标,从共性转移到个性,成为可能41.3转录组研究的技术主要包括如下三种:1)基于杂交技术的微阵列技术;2)基于Sanger测序法的SAGE(serialanalysisofgeneexpression)和MPSS(multipleparallelsignaturesequencing);3)基于新一代高通量测序技术的转录组测序。5几种转录组研究所用技术的比较6DNA芯片技术:只适用于检测已知序列,却无法捕获新的mRNA。杂交技术灵敏度有限,对于低丰度的mRNA,微阵列技术难以检测,也无法捕获到目的基因mRNA表达水平的微小变化。7SAGE(基因表达系列分析):可以全面了解特定组织或细胞类型中基因群体表达状态,它的显著特点是能够大量获取基因组范围基因表达的类别与丰度,该技术成功地应用于特异组织或细胞的转录组研究和mRNA群体间差异表达基因鉴定。缺点是需要大量的mRNA8大家有疑问的,可以询问和交流可以互相讨论下,但要小声点9MPSS(多重性平行定序):对于功能基因组研究非常有效,能在短时间内捕获细胞或组织内全部基因的表达特征;对于鉴定致病基因并揭示该基因在疾病中的作用机制等发挥了重要作用。可以侦测到极为罕见的基因表现10

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