1.转录组2.高通量测序3.转录组数据分析4.差异表达基因分析5....

可以了解特定基因的活性和表达量,用于疾病的诊断和治疗通过对转录组的研究,也让个性化医疗的目标,从共性转移到个性,成为可能1.3转录组研究的技术主要包括如下三种:1)基于杂交技术的微阵列技术;2)基于Sanger测序法的SAGE(serialanalysisofgeneexpression)和MPSS(multipleparallelsignaturesequencing);3)基于新一代高通量测序技术的转录组测序。几种转录组研究所用技术的比较转录组所用技术MicroarraySAGE和MPSSRNA-seq原理寡核苷酸杂交Sanger测序高通量测序信号荧光信号数字化信号数字化信号分辨率数个-上百个单碱基单碱基分辨率高低高背景高低低成本高高相对较低起始RNA用量多多少DNA芯片技术:只适用于检测已知序列,却无法捕获新的mRNA。杂交技术灵敏度有限,对于低丰度的mRNA,微阵列技术难以检测,也无法捕获到目的基因mRNA表达水平的微小变化。SAGE(基因表达系列分析):可以全面了解特定组织或细胞类型中基因群体表达状态,它的显著特点是能够大量获取基因组范围基因表达的类别与丰度,该技术成功地应用于特异组织或细胞的转录组研究和mRNA群体间差异表达基因鉴定。缺点是需要大量的mRNAMPSS(多重性平行定序):对于功能基因组研究非常有效,能在短时间内捕获细胞或组织内全部基因的表达特征;对于鉴定致病基因并揭示该基因在疾病中的作用机制等发挥了重要作用。可以侦测到极为罕见的基因表现1.4转录组测序(1)RNA聚合酶I和III负责种类稀少、功能重要的看家非编码RNA基因的转录,包括rRNA,tRNA,snoRNA,snRNA等。由这两类RNA聚合酶转录的非编码RNA属于看家RNA,在各种生理和病理状态下都被高水平转录,转录产物占细胞内RNA总量的95%以上,不是生命科学研究前沿领域的主要关注对象