4分子系统学的新进展

分子系统学的新进展黄原 2006-9 主要内容? 1 DNA 条形码? 2 组装生命之树? 3 谱系基因组学? 4 系统发育信息学? 5 系统发育分类学? 6 系统发育生物学 1. DNA 条形码 DNA barcode 什么是 DNA 条形码? ?能够用于识别和鉴定某一类群所有物种的一段 DNA 序列. ? DNA 条形码是由 DNA 序列上 A、C、G和 T 4 种碱基组成及其次序决定的。 DNA 条形码标记的要求?在某一类群的所有物种中都有这段 DNA 序列. ?必须是物种特异性的. ?可以使用简便的方法进行研究. ?在物种之间长度变异不大. 建议的 DNA 条形码标记? COI gene ? 18S rRNA gene ? 16S rRNA gene COI 基因是首选标记? COI 基因 5’约 648bp. ? COI 不适用于植物. ? COI 在两栖类进化速度很高, 不适用于两栖类. DNA 条形码识别原理?建立地球上所有物种的 DNA 条形码数据库?测定待鉴定标本的条形码序列?将待鉴定标本的条形码序列与条形码数据库中的所有记录进行比对?根据比对结果中与最近邻居的条形码差异做出结论:已知物种或未知物种。 DNA 条形码的意义?快速而准确的识别和鉴定物种?使非专业人员也能鉴定物种?野外物种识别 DNA 条形码是技术而非科学? DNA 条形码仅供物种识别. ? DNA 条形码应该跟物种学名一样有承载它的凭证标本( vouchered specimen) 或在微小型种类中有数码图象凭证. ? DNA 条形码序列应该提交到专门的条形码数据库中. ?根据 DNA 条形码进行物种识别的前提条件是已经测得并建立了相关类群所有物种的条形码标记的数据库.