环状rna(circrna)研究技术手册doc_图文

环状RNA(CircRNA)研究技术手册10二、CircularRNA研究工具1.circRNA数据库NameDescriptionLinkReferencesdeepBase包含了大约15万的circRNA基因(人、鼠、果蝇、线虫等),构建了最全面的circRNA的表达图谱!经常无法访问!(坑爹)http://deepbase.sysu./circRNABasemiRNA-circRNA相互作用网络数据库http://starbase.sysu./mirCircRNA.php[1]circBasecircRNA公共数据库,汇集大量已知或未知功能的circRNA数据(RNA-seq数据等)/[2]Circ2TraitscircRNA功能数据库,汇集于circRNA相关的疾病及表征形状数据。经常无法访问!(坑爹)http://gyanxet-/circdb/[3][1]Li,JH;Liu,S;Zhou,H;Qu,LH;Yang,JH(Jan1,2014)."starBasev2.0:decodingmiRNA-ceRNA,miRNA-ncRNAandprotein-worksfromlarge-scaleCLIP-Seqdata.".NucleicAcidsResearch42(1):D92–7.doi:10.1093/nar/gkt1248.PMID24297251.[2]Memczak,S;Jens,M;Elefsinioti,A;Torti,F;Krueger,J;Rybak,A;Maier,L;Mackowiak,SD;Gregersen,LH;Munschauer,M;Loewer,A;Ziebold,U;Landthaler,M;Kocks,C;leNoble,F;Rajewsky,N(Mar21,2013)."CircularRNAsarealargeclass