Р同时,对于需要研究性状,我们需要对其进行界定,比如果实大小,我们需要测量成熟后几天的果实,作为统一的判定。以保证性状测量的准确性。Р为了能够获得准确的田间试验数据,应该采用良好的田间试验设计。在此,建议:Р现有的两个群体材料都为永久性群体,一般可以采用随机区组或是裂区设计,每个系2~3个重复,鉴定表型。因此我认为我们应该进行田间实验设计,保证表型数据的准确性。Р3 SNP指纹图谱构建:Р通过已经获得的全基因SNP分子标记,进一步可以从中挑选出稳定、一致的48对SNP分子标记构建番茄的指纹图谱。挑选参数为:Р3.1 等位基因频率(Allele Frequency)Р在一个二倍体的某特定基因座上某一个等位基因占该基因座上等位基因总数的比率,是群体遗传结构的一个最基本的尺度,该基因座上所有等位基因的频率之和为1,对于SNP分子标记,一般只包括两种等位基因。因此,其等位基因频率在~0.5时为最适宜值。Р3.2 多态性信息含量(Polymorphism Information Content,PIC):Р多态信息量(Polytnorphism Information Content,PIC)由Botstein等在1980年提出,用来评价一个多态性基因座使用价值的一个量化概念。PIC由该基因座的等位基因数、等位基因频率分布两个因素决定。标记基因座的等位基因数越多、各等位基因频率分布越均匀,PIC越大。Рi= 第j个分子标记中第i个等位基因Рn =第j个分子标记的等位基因的数目。Рp =等位基因频率Р3.3 核心引物分组:Р另外,还需要根据SNP分子标记在全基因上的分布进行筛选,要求4个SNP分子标记/染色体,并且要求其分子标记之间的距离越远越好。在玉米中,利用40对SSR引物构建指纹图谱,他们针对这40对引物分成两组。我们可以采用相同策略,将我们的48对引物分成两组,用于将来的检测。
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