细胞缺陷小鼠构建小鼠骨髓嵌合体动物模型,研究这些差异表达的基因或miRNA对共培养后肿瘤细胞侵袭转移能力的影响;采用基因工程小鼠模型,从分子、细胞、动物三个层面研究TGFβ信号通路在肿瘤微环境中与REGg蛋白酶体激活因子、p53等重要肿瘤因子动态相互作用及其动态调控的分子机制。在解析这些调控机制的生理病理意义的基础上,通过肿瘤模型研究进一步阐明肿瘤微环境中重要生物学因子对肿瘤发生发展的决定性作用。具体方案如下: РmRNA及miRNA表达谱分析Р正常乳腺组织及不同类型的乳腺癌组织Р建立基质细胞与肿瘤细胞的三维细胞培养模型Р明确基质细胞的基因/miRNA对肿瘤转移的影响Р肿瘤相关成纤维细胞原代培养РTGFβ信号通路/REGg-蛋白酶体Р动物水平РSmad2亚等位基因表达小鼠模型Р阐明REGg-蛋白酶体与TGFβ信号通路间的相互作用Р细胞微环境与肿瘤发生发展及侵袭转移Р基质细胞、细胞因子在肿瘤发生发展中的作用Р分子、细胞水平Р基因/miRNA的功能研究Р基因敲除Р建立肿瘤与细胞微环境网络体系Р肿瘤相关性巨噬细胞Р免疫缺陷Р小鼠骨髓嵌合体动物模型构建Р Р课题负责人:刘芝华,中国医学科学院肿瘤研究所Р学术骨干:李晓涛,华东师范大学生命科学研究所Р曲春枫,中国医学科学院肿瘤研究所Р课题六:恶性肿瘤发生发展及侵袭转移的分子调控网络Р利用肿瘤基因表达和表观遗传学数据,采用计算生物学方法推测在恶性肿瘤、干细胞中发生变化的表观遗传学调控网络。为了更深入地研究肿瘤发生发展过程的分子调控网络,还需要从以下几个方面进一步发展基于贝叶斯网络的因果推断方法。(1)考虑到实验方法与手段的多样性,需要开发能够自动整合并利用多个异质实验数据的因果推断方法。这部分工作涉及去除反映单个数据源自身特征的背景信号,子网络的拼接与集成,观测型实验数据与(基因敲除、RNA沉默等)干预型实验数据的因果信息集成等多个问题
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