化和生长命运的ncRNA及其相关蛋白,不仅为治疗恶性肿瘤提供了新的靶点,还提供了合适的靶细胞群,这将成为新一代的肿瘤基因治疗手段。Р(3)为研究ncRNA相关蛋白调控肿瘤提供新的模型:本项目将着眼于恶性肿瘤内维持其生长的特殊细胞群——肿瘤启动细胞,通过筛选、识别和鉴定参与调节恶性肿瘤启动细胞基因表达的ncRNA及其相关蛋白质,研究它们对肿瘤启动细胞分化命运的调控作用,从而为ncRNA-蛋白质调控网络调节肿瘤发生发展的研究提供了一个动态的崭新的生物学模型。此外,最新的研究发现肿瘤细胞自噬与治疗抵抗有关,本研究通过分析自噬过程中ncRNA相关蛋白的功能,阐述其对肿瘤治疗抵抗的作用,为研究肿瘤治疗敏感性提供新模型。Р(4)在部分交叉研究领域进行首次研究:有关ncRNA及其相关蛋白调控肿瘤治疗抗性的研究在国际上才刚刚展开,目前尚缺乏系统和深入的研究;此外,目前文献中尚未有ncRNA相关蛋白调控细胞自噬的报道,结合课题组温龙平教授团队首次发现的纳米颗粒可以通过ncRNA调控细胞自噬,为纳米生物学及纳米安全性研究提供新线索。Р技术方法创新:Р(1)RNA组学平台在肿瘤特异ncRNA筛选中应用:本研究将采用RNA组学方法,并结合深度测序和计算生物学方法,建立高通量筛选和鉴定ncRNA技术平台,将有效地发现不同长度和类型的新的肿瘤特异的ncRNA。Р(2)肿瘤相关ncRNA相互作用蛋白系统研究:本研究采用基于生物质谱分析的蛋白质组学技术、酵母三杂交技术、SELEX技术、CLIP(crosslinking and immunoprecipitation)方法以及蛋白复合体分离检测技术等多种新技术新方法,并有机结合计算生物学方法,理论与实验科学相结合,高通量和特异性相结合,是一种新的ncRNA相互作用蛋白研究策略。这也是国内首次开展大规模的肿瘤特异的ncRNA及其相关蛋白的发现和作用机制研究。
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