数据更快、有望大大降低测序成本,改变个人医疗的前景。第三代测序技术的基本原理是在纳米孔中配置纳米电极,用电测方法测量一个DNA的核酸碱基排列。阐述利用生物分子数据进行系统发生分析基本原理.icanalysisusingbiologicalmoleculardata.在现代分子进化研究中,根据现有生物基因或物种多样性来重建生物的进化史是一个非常重要的问题。一个可靠的系统发生的推断,将揭示出有关生物进化过程的顺序,有助于我们了解生物进化的历史和进化机制。根据核酸和蛋白质的序列信息,可以推断物种之间的系统发生关系。其基本原理非常简单,从一条序列转变为另一条序列所需要的变换越多,那么,这两条序列的相关性就越小,从共同祖先分歧的时间就越早,进化距离就越大;相反,两个序列越相似,那么它们之间的进化距离就可能越小。为了便于分析,一般假设序列变化的速率相对恒定。请阐述分子系统发生分析过程。icanalysis.分子系统发生分析主要分成三个步骤:(1)分子序列或特征数据的分析;(2)系统发生树的构造;(3)结果的检验。其中,第一步的作用是通过分析,产生距离或特征数据,为建立系统发生树提供依据。系统发生树的构建方法很多种。根据所处理数据的类型,可以将系统发生树的构建方法大体上分为两大类。一类是基于距离的构建方法,利用所有物种或分类单元间的进化距离,依据一定的原则及算法构建系统发生树。另一类方法是基于离散特征的构建方法,利用的是具有离散特征状态的数据,如DNA序列中的特定位点的核苷酸。建树时,着重分析分类单位或序列间每个特征(如核苷酸位点)的进化关系等。通过某种算法构造好一棵系统发生树之后,需要对树的合理性和可靠性进行分析。对于若干条序列,如果利用多种不同的分析方法进行系统发生分析,并且得到相似的进化关系,那么分析结果具有较高的可信度。简述蛋白质二级结构预测最近邻方法的基本思想和算法的执行过程。
全文预览
