13年项目申请单位(中国农业科学院和中国科学院遗传与发育生物学研究所)将举办“国际茄科基因组大会”,估计将有200多名国际同行和300多名国内同行参加。这种密切的国际合作为本项目的研究提供了国际视野,也提升了我国科学研究在国际的影响力。(四)课题设置基于项目拟达到的总体目标,以“蔬菜商品和风味品质性状形成的遗传构成和基因调控机制”的关键科学问题为切入点,共设置6个研究课题。课题1蔬菜品质性状全基因组关联分析蔬菜品质性状是多基因控制性状,而全基因组关联分析(GWAS)是研究多基因性状的有力手段。全基因组遗传变异图谱,是GWAS的必需“蓝图”。本课题重点开展以下研究:1.主要研究内容种质资源品质性状的观察分析:对白菜、甘蓝、黄瓜和番茄种质资源的品质性状,包括白菜和甘蓝的结球习性和紧实度、未熟抽薹和裂球率,黄瓜瓜把长度、畸形果率,番茄果实形状、大小、畸形果率、裂果率,黄瓜果实苦味和清香味等风味物质的化学成份等,进行观察测定。全基因组遗传变异图谱构建:在白菜、甘蓝、黄瓜、番茄的全基因组序列基础上,利用不同种质资源的重测序数据,定位所有SNP位点和结构变异位点(Structuralvariation,SV),确定全基因组范围内的连锁不平衡区块。全基因组关联分析:在性状调查和全基因组变异图谱的基础上,通过关联分析,确定白菜、甘蓝叶球的形态建成、黄瓜和番茄果实的形态建成,以及黄瓜苦味和清香味物质代谢的关键遗传位点。2.研究目标创建白菜、甘蓝、黄瓜和番茄的全基因组遗传变异图谱,包含至少100万个SNP标记和5万个SV标记,确定控制叶球、果实形成、风味物质代谢的关键遗传位点,为关键基因的分离和鉴定提供候选基因。课题承担单位:中国农业科学院蔬菜花卉研究所北京师范大学浙江大学课题负责人:黄三文研究员学术骨干:林魁,曹家树,张忠华,程峰经费比例:18.6%课题2蔬菜品质性状形成关键基因的分离与鉴定
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