“合肥环境工程研究院”、“安徽省固体废弃物能源化利用工程技术研究中心”、“安徽省建筑节能技术平台”中德合作环境技术转化中心、合肥学院房地产研究所、环巢湖文化与经济社会发展研究中心等研究机构24个,其中省、市级研发平台4个。建有“深装合大工业设计有限公司”、“安徽合大环境检测有限公司”、“合肥学院—新方舟创意工场”等一批校企共建的“嵌入式”实验室。与荣电集团共建省内第一家“产品研发设计中心”。为了改善教学和科研条件,近三年来,学校共计投入1.1亿元,新建和改造各类实验室53个。今年,计划再投入3500万元,新建和改造17个实验室。截止目前,学校共有各类实验室123个。近三年来,学校先后组织了各研发平台的教授、博士参加了“第五届安徽省(马鞍山)产学研合作项目对接会暨第四届产学研合作网上对接周”,“在皖高校深化拓展‘大别山道路’暨服务老区加快发展推进会”、“山东省产学研展洽会”、“百名专家淄川行暨科技成果引进洽谈会”、“农业高新技术产业对接会”等活动。先后组织了近百名教授、博士深入企业,与企业交流洽谈,收集企业需求信息,为开展全面合作打下了良好的基础。2011年至今,学校共承担各类横向课题80多项。承担了“合肥市轨道交通1、3号线主体维护结构的监测与分析”、《合肥半汤、汤池国际温泉度假区概念规划及城市设计》、“合肥市工业设计平台建设调研报告”、合肥热电集团污泥掺烧技术、“高校光伏电站建设模式与应用示范研究”等一批研究项目。近五年,人文社科应用性成果的数量在全省高校中名列前茅。2013年,与中国科学院过程工程研究所合作,成立了合肥学院水环境治理及污染控制院士专家工作站,承担了巢湖流域82条河流底泥污染物分析等工作,派河解析和保护方案制订工作已进入收尾阶段,环巢湖流域清洁生产工作已开始启动,污泥干化和蓝藻脱水研究取得阶段性成果。引进英国Strathclyde大学罗熙淳教授、中国科学院