谱技术Р 质谱分析技术是一个强大的分析技术。它可以用来识别未知化合物和量化已知化合物,并Р阐明一个分子的化学性质。质谱(MS)是几乎所有蛋白质组学实验的核心。基本上,占主导地Р位的MS工作流程开始于一个特定位点的酶消化,使蛋白质变成肽。接下来,肽被处理成挥发性Р物质,质谱仪产生每个样品的光谱图。最后,把光谱图与数据库里的肽序列进行比较,推断蛋Р白质序列。Р MS实验的第一步,酶消化是由1个蛋白酶(如胰蛋白酶)完成的。为了使肽变成挥发性物Р质,人们通常采用两种方法——基质辅助激光解吸/电离(MALDI)和电喷雾(ESI)。MALDIР用于挥发含有少量肽的混合物;电喷雾用于挥发含有大量的肽的肽混合物。最后是生物信息学Р方案,即光谱(观察到的峰)的处理和与可以消化的蛋白质序列数据库的肽序列比较。由于蛋Р白质鉴定依赖于与序列数据库匹配,目前蛋白质组学主要限制那些综合序列数据库可用的物Р种。Р MS可直接应用的是检测蛋白质或肽的峰。它们的质量和所带电荷不同,从而可以将癌症患Р者的样品与正常个体的样品进行比较。例如,采用这一方法,Nakagawa等人确定了两个乳腺癌Р相关的多肽;Hao等人确定了一些有关胃癌的多肽;而Sun等人则确定了116个可以用来区分肝Р癌和正常肝细胞的蛋白质。Р 即使MS的应用对癌症研究有巨大的潜力,但由于个体间的基因变异和血浆蛋白质组动态变Р化是多种因素(如性别、年龄和健康状况)综合的结果,所以这种类型的分析仍然存在一些大Р的障碍。Р 五、各种“组学”信息的整合Р 正如以前指出的那样,在基因组学、转录组学和蛋白质组学方面的进展为生物学家提供了Р大量要处理的数据。然而,这些数据大多来自不同的平台或存储在不同的数据库中,数据整合Р是非常不容易的,甚至是不可行的。鉴于此,人们希望形成一个生物信息学的特定领域,以便Р解决这些很重要的问题,这就是“整合基因组学”。Р 33
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