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岩溶地下河水微生物分布特征研究——以重庆雪玉洞地下河为例

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文档介绍
来的。 2.微生物群落研究(1)微生物分类从表型特征描述到分子生物学鉴定自然界物种繁多,生物多种多样。在生物圈的化学平衡中微生物发挥了非常重要的影响,然而我们对维系平衡的微生物生态系统了解的非常少。微生物研究的传统方法是通过平板纯化培养而获取微生物菌株,然后对其进行形态学描述, 然而并不是所有的微生物都可以通过纯化培养的途径获得,大自然中的微生物只有1%能够通过纯化培养获取单菌落,大多数无法进行纯化培养的微生物无法通过纯培养对具体特征进行描述,另外,通过传统方法获取的微生物形态学信息对于研究微生物进化作用有限。 20世纪70年代之前主要是通过培养特征、生理化学特征的对比进行分类。到20世纪70~80年代,微生物分析技术和设备取的较大发展,对已有菌种化学成分的数据分析,建立了给微生物分类的生物标记物分类法。在80年代和90年代, 随着分子生物学技术的发展,核酸序列技术在菌种的鉴定以及细菌发育研究中的利用,因此对菌种的分类研究比以前更加深入和详实【30】,从表面的形态学描述深入到内部的遗传信息研究,在水体微生物生态学研究中运用分子生物学技术手段, 规避了传统的富集纯化培养分离研究过程中可能存在的例如微生物多样性的丧失、种群组成产生变化等弊病,能够直接反应环境微生物的原始组成状况。当前,各种微生物的遗传信息特征和分子差异的研究广泛运用rRNA分子指标,并且许多研究比较深入的微生物的DNA测序结果被整理出来组成国际基因数据库,微生物鉴定分类过程中基因数据库就成为特别适用的参考体系,首先对未知的微生物进行DNA序列测定,然后将测序结果和基因数据库进行对比分析,就实现了对未知微生物开展较快分类的目标【31|,因而就可以准确的探知微生物种群特征和遗传特征。(2)运用1 6SrRNA对微生物分类鉴定 Pace[32J首先运用rRNA基因来鉴定样品中存在的微生物种群特征,rRNA一般万方数据

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