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NetWork软件的使用

上传者:upcfxx |  格式:doc  |  页数:31 |  大小:2420KB

文档介绍
这样的显示也变得十分困难。在系统发育分析中的星聚法计算程序能够展示系统树或中介网络图更小的骨架,因为它把一个聚类看作一个节点。其二,星聚法计算程序能够严格的判定预示着人口统计学扩张的密集的星形聚类。这些系统发育聚类分支的合并时间可以通过分子钟确定,而且能够与历史或史前的其它规律的记录进行比较。另外,星聚法计算程序在处理利用人类线粒体来解释人类起源、进化、迁移等事件时,非常有用。Р点击“Optimal Pre-Processing”选项中的“Star Contraction”,会弹出如下图(Fig2.2)所示操作界面:РFig 2.2Р如上图操作界面,点击“File”按钮,选择要分析的数据文件,此运算程序可以接受以下列为扩展名的数据文件:“*.rdf”、“*.ych”、“*.rmf”、“*.tor”、“*.phy”、“*.nex”。Р引入数据文件,点击“Parameters”按钮,操作界面变为如下图(Fig2.3)所示:РFig 2.3Р通过上述操作界面,可以设置星形聚类的最大半径,其范围为从1到10,选择合适的数据,点击“Set”按钮。之后“Calculation”按钮被激活,点击此按钮,即可进行此程序的运算。不过事先要把数据保存于一个扩展名为“*.pro”的文件中。其弹出的对话框,如下图(Fig2.4)所示:РFig 2.4Р每运算一个循环,可以选择是否继续此运算,弹出的对话框,如下图(Fig2.5)所示:РFig 2.5Р如上图操作界面,点击“Yes”按钮,即可继续进行此运算,运算结束后,会弹出如下图(Fig2.6)所示的对话框:РFig 2.6Р如上图所示,代表运算已经完成,点击“OK”按钮,即可结束,并弹出一段话框,如下图所示(Fig2.7),可以保存运算结果,结果文件的扩展名为“*.sco”work做中介网络计算的程序识别,也可以被其它构建系统发育树的程序所识别。

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