而水垢和微生物膜形成的隔热层对正常的热交换产生阻碍作用,两者相互作用使制冷系数C.O.P值(下降(能效比)表3),从而导致主机负荷功率加大。制冷机组的压缩机不得不加大运转功率,以补偿由于冷凝管中水垢和污垢造成的热交换损失。由于加大功率,空调系统损耗了更多的电能下图为污垢对制冷系数EER的影响为了减缓上述现象的出现,水冷螺杆系统无论是主机还是冷却水的水泵和冷却水塔,都留有较大的设计余量,这样势必导致初投资和实际运行成本远远高于上表的理论计算值。为了减少热交换损失节约电能并减少微生物膜对管壁的腐蚀,至今为止人们一般采取定期进行化学清洗的方法来去除管壁上的水垢和污垢,但是由于技术原理上的限制一直不能根本解决问题。由于化学药剂的成本以及清洗人工的费用等原因,化学清洗不可能每天进行,大多数情况下每年清洗1~2次。而中央空调系统一般开机200小时左右冷凝器管道中水垢和污垢就会不断形成和积累,热交换效率开始降低,电能浪费开始产生。同时,化学清洗方法使用的化学药品本身对管壁会产生腐蚀作用,也会缩短空调系统的使用寿命。而每次化学清洗产生几百吨化学污水的排放更是直接破坏了自然环境,并不断对居民生活的安全造成威胁。除了化学清洗方法之外,还有通过电磁手段减少水中污垢的产生等相关的技术,但是从科学原理到具体实践的无数事例都证明了这些方法有一定的作用,但是也跟化学清洗方法一样都无法从根本上解决冷凝器管壁上水垢和污垢的形成和清除问题。综上,虽然水冷式空调机组较之风冷机组价格要便宜,高峰用电稍小,但由于增加了冷却水系统,因此系统的设备一次总投资与风冷机几乎持平,但全年能耗、安装费用却高于风冷式,加上其它因素,如水冷机在机房占地,建筑美学的劣势,所以近几十年来世界上风冷机组的使用比例逐年上升,仅1988年在美国风冷式机组已占总销售额的78%。目前在我国国内采用风冷机组作为空调系统的冷源已形成强大的发展势头。