D)能够提供蛋白与膜的相互作用以及肽链构象变化动力学过程的详细信息,能给出很多实验上无法观测或只能间接猜测的细节,是对实验研究很好的补充。借助于超级计算机,利用已开发的生物分子的力场参数来进行模拟计算,己成为研究蛋白质折叠的一个常用手段。本文通过分子动力学模拟计算,研究了2型糖尿病致病蛋白hIAPP单体吸附倒生物膜上的过程,分析了hIAPP单体与生物磷脂膜的相互作用及对磷脂膜的影响,以期对hIAPP在膜环境下的聚集及其毒性有更进一步的理解。§1.2hlAPP介绍§1.2.1蛋白质结构与性质蛋白质是一条或一条以上的肽链按照特定方式折叠形成的具有特定的结构和功能的生物大分子。蛋白质的基本组成单位氨基酸,每个氨基酸含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物,天然氨基酸中氨基是连在0c一碳上的,氨基酸之间以肽键相连。常见氨基酸有20种,它们是甘氨酸(glycine)、丙氨酸(alanine)、万方数据缬氨酸(valine)、亮氨酸(1eueine)、异亮氨酸(isoleucine)、甲硫氨酸(methionine)、苯丙氨酸(phenylalanine)、色氨酸(tryptophan)、脯氨酸(proline)、丝氨酸(serine)、苏氨酸(threonine)、半胱氨酸(cysteine)、酪氨酸(tyrosine)、天冬酰胺(asparagine)、谷酰胺(glutamine)、天冬氨酸(asparticacid)、谷氨酸(glutamicacid)、赖氨酸(1ysine)、精氨酸(arginine)、组氨酸(histidine)。具体结构见下图。20种常见的蛋自质氨基酸R基不带电荷的氨基酸’州一i一“‘州一{一“‘州一{一“鼍量吱一}/弋图1-120种基本氯基酸蛋白质具有非常复杂的特定的空间结构,并具有一定的规律性,可以分为一级结构、二级结构、三级结构和四级结构。4万方数据
全文预览
