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人类微球蛋白氨基酸片段的全原子分子动力学模拟蛋白质聚集分子机制研究

上传者:读书之乐 |  格式:pdf  |  页数:55 |  大小:7214KB

文档介绍
.89和91-96单独存在时都能形成纤维结构【32’33,34]。另一方面,Ferri等人利用抑制抗体作用于微球蛋白的各片段,发现抗体结合在片段92.99的位置可以阻止纤维的形成,然而结合于片段20-41或63-75并没有太大的影响【35】。其后,Eisenberg等人利用人类和老鼠的微球蛋白对比,发现片段83.89在序列上的差异会造成完全不同的结果,于是预测人类微球蛋白的尾部片段83-99会形成典型的B发夹结构,而这部分聚集组合成纤维的骨架,而蛋白的其它部分仍维持球型结构悬挂在纤维主轴的周围【33】,如图1_4所示。此外,Eisenberg等人6将各种由不同蛋白片段聚集而成的纤维结构归纳分类,并在结构和侧链位置上做了详细的描c。一。,馘二=一D一’堆_■h删:{嘲嗡,,。,_·一∞商磁‰,一一~J-_酗峨.图1-4.Eisenberg等人利用电子显微镜观测的影像和提出的纤维模型自然态中片段20-41因具有反式结构的Pr032,经许多实验证实也是形成纤维结构的主要原因[37,38,39,40]。Goto等人也发现单独存在的片段20-41(又称为I(3片段)在很多不同的溶液环境下皆可以形成纤维结构,利用固体核磁共振确定了其结构,他们提出位于His31和Pr032之间的肽键必须是反式结构(transconfigurafion),并且片段20-28的侧链方向和自然态相比正好相反,疏水侧链Phe22和Tyr26埋藏在两层13.sheet之间,如图1.5和图1.6所示【41】。而这和AB1-42纤维有很相似的拓朴结构【42-43]。p二。鬻黛』艘氧辎燕埘蛾轳矽篡肾略钳甲辚瓣钨秽薯雾葱黪、j戡裂囊囊黉?j《臻巍熬i确露戮∥翟赣B毽纛翌警譬蔫蒸:≥,《囊囔譬譬”‘一≮:羹隳雾季馨黪薯'j掣图1.5.Goto等人利用固体核磁共振观察并提出的豳纤维模型7stateivestate嚣謦嚣黪燮《

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