时间相对较长。Drude振子模型引入了一个无质量的带电粒子附着在极化原子中心。通过对这些“附加”的位置自洽地调整来反映体系的极化。Drude振子模型和诱导偶极模型没有考虑电荷转移,这对生物分子的模拟是致命的缺陷。浮动电荷模型没有自洽迭代的过程,并且考虑了电荷转移。通过密度泛函理论中的电负性均衡模型(Electronegativityequalizationmodel,缩写为EEM)[54】或化学势均衡模型(Chemicalpotentialequalization,缩驯jCPE)1551快速计算出体系中所有位点的点电荷。浮动电荷模型允许点电荷随环境的改变而变化。杨等人156‘弱J提出的ABEEM佩模型,即嘲K平的原子.键电负性均衡方法,允许点电荷值随环境变化而改变,从而适当地反映体系的极化现象。该模型将一个分子的电子密度分为原子区域、键区域(包括棚楗)以及孤对电子区域。最近,ABEEM舰模型与分子力场(MM)相融合建立了新一代的可极化力场(Polarizableforcefield,缩写为PFF),【58,59IABEEMoTr浮动电荷力场,已经成功地应用于气相水分子团簇和水溶液,[591离子水溶液,[60-621和生物分子体系。【58'631研究结果表明ABEEM佩方法优于通常的力场方法,并且它的结果可以与MP2方法媲美,并得到广泛的使用。已有多篇国外重要杂志对ABEEM彻模型及力场进行了高度评价,说它是最有希望的方法之一。[64,651本文以实验数据和高水平的量子化学方法为基准,发展了适用于含氧化嘌呤碱基对体系的ABEEMan-浮动电荷力场,并对其结构和性质进行了探讨。我们做了大量关于量子化学方法、ABEEMan"浮动电荷力场和其他力场方法的计算并进行探索、尝试和校准。为含氧化碱基DNA大分子体系的动力学模拟奠定基础,并预测氧化嘌呤诱导的突变路径,为癌症的治疗提供帮助。
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